Изогните цепочку остатков поперек сетки так, чтобы гидрофобные единицы сбились в скрытое ядро, и сведите энергию до доказанного минимума.
Как играть
Белок моделируется как цепочка гидрофобных (H) и полярных (P) остатков на двумерной решетке. Гидрофобные соседи, расположенные рядом и не связанные друг с другом, снижают энергию. Ваша цель — сложить цепочку так, чтобы остатки H образовали компактное ядро, и вы достигнете оптимальной энергии.
Нажмите на остаток, чтобы повернуть хвост цепи вокруг него.
Поочередно щелкните тот же остаток, чтобы повернуть его в противоположном направлении.
Используйте кнопку «Вращение», чтобы изменить направление поворота по умолчанию (по часовой стрелке или против часовой стрелки).
Достигните доказуемого минимума энергии цепи, чтобы выиграть головоломку.
Элементы управления
Рабочий стол: щелкните остатки, чтобы повернуть, щелкните еще раз, чтобы повернуть вспять, переключите «Вращение» и используйте «Сброс», чтобы выпрямить.
Телефон и планшет: нажимайте на остатки для поворота — полностью сенсорное управление.
Советы и стратегия
Считайте контакты H-H, а не форму — каждая несвязанная гидрофобная пара, оказавшаяся рядом, теряет энергию.
Стремитесь к компактной капле, а не к длинной руке; Площадь поверхности, подверженная воздействию остатков H, является пустой тратой энергии.
Когда сгиб останавливается, выполните перезагрузку и попробуйте сначала посеять ядро из самого плотного кластера остатков H.
Что вы узнаете
Helixfold построен на классической гидрофобно-полярной решетчатой модели сворачивания белка, превращая поиск складки в головоломку.
Навыки: биохимия, сворачивание белков, модель HP, оптимизация.
Подходит для: средней школы/колледжа продвинутого уровня.
Для родителей и учителей: модель сворачивания белка HP.
Происхождение
Цепочка гидрофобных и полярных остатков на решётке, где несвязанные контакты H-H снижают энергию, — это HP-модель сворачивания белка.
Оригинальный подход — прямая оценка энергии, а не сходства с известной формой.
Энергия — правильная цель, потому что именно её минимизирует природа. Гидрофобный эффект загоняет неполярные остатки внутрь, и модель, почти ничего больше не содержащая, всё равно воспроизводит компактное ядро настоящих белков, — поэтому HP-модель сохраняется как учебный и исследовательский инструмент.
О Хеликсфолде
Helixfold построен на классической гидрофобно-полярной решетчатой модели сворачивания белка, превращая поиск конформации с минимальной энергией в тактильную головоломку. Это оригинальная бесплатная браузерная игра с тремя длинами цепочек и ежедневными режимами плюс тренировка.
Оригинальная бесплатная игра в браузере — без загрузки. Смотреть все игры →
